从2011年4月起，市博物馆馆长张建军、副馆长陈振忠及郭雁冰、杨华芳、彭俊美等专家曾前后四次到东澳岛调查和勘探，发现“东澳关”标识有误，并撰写了一份《拱北关东澳岛海关遗址调查与勘探报告》，提供了大量遗址资料与采访记录。

    据市博物馆工作人员杨华芳介绍，真正的“东澳关”在东澳岛一个土名叫“烂泥塘”的小海湾，从海湾沿着土名“刀马快山”的古道走上去，沿途2公里的古道上散落了大量海关遗迹，从下至上分别为：报关船泊船处、水手房遗迹、海关古道遗迹、海关办公区遗迹、海关水井遗迹、海关生活区遗迹、海关烽火台遗迹。

    4月11日，市博物馆专家再次考察东澳关遗址，杨华芳说水手房只剩下约25平方米的遗迹，此处原来还有约100平方米的平台，站在平台边缘可以俯瞰整个海湾，预防海盗劫持税金。

    据悉，东澳海关有一处烽火台在“散石湾顶”，目前已被拆毁，此烽火台与铳城烽火台遥相呼应，铳城烽火台可以向桂山方向发信号，此处烽火台可以向澳门方向发信号。

    另外，在海关遗址古道旁还残存着一口水井，水井已干枯，井里填埋垃圾现在只剩3.3米深，井圈为灰砂筑成近圆形。据村民介绍，上世纪五十年代还抽过井水灌溉农田。

    在海关生活区遗迹处还有厕所、厨房、排水沟、廊道等遗迹，廊道地板砖的填土中发现了三件残铁器。

    广东省政协常委、省社科院教授陈忠烈到东澳岛考察，他看到东澳海关遗址非常激动，他说东澳岛铳城规模并不算大，深圳、饶平等地的铳城比东澳岛的面积还要大，但是东澳岛铳城与东澳海关结为一体的边防要塞，其规模在广东省内罕见，可将两处遗址联合进行开发，使之成为珠海海岛旅游的新景点。

    万山区有关负责人表示，东澳海关纪录了珠海一段重要历史，可先将东澳关遗址部分复原，并开发为陈列馆，让更多的人了解珠海历史。东澳岛南部的南沙湾已经形成现代化的海滨度假旅游区，东澳岛北部可开发铳城与海关遗址，形成有历史沧桑感的古迹陈列区，进一步丰富海岛旅游内涵。